隨著資訊科技進步，資訊素養已然成為企業管理與營運發展的重要資源，而資訊系統的引進，更是組織面對激烈競爭時的關鍵成功因素，目前產業正轉變為以資訊結合其他領域知識為導向的跨領域環境,是故結合資訊與管理二大領域的人才的培養，實為國家競爭與產業發展的重點工作。
基於時代趨勢以及配合國家產業發展,結合企業資訊化人才需求，本校於民國83年成立資訊管理學科，致力於培育我國資訊管理相關人才。民國89年隨著學校改制由原二專學制改為四技學制，資訊管理科更名為資訊管理學系，並自民國90年起開始招收日間部四技學生，民國93年起開始招收進修部四技學生。
本系發展沿革與大事略紀
第一屆系友回娘家活動，第一屋系友會成立。由老師們及系友們捐助餐會,齊聚龍星話當年
升級本系第二電腦教室，採用M2.2280界面之PCI-e規格硬碟1TB，以改善教學環境。自此,本系電腦教室己將PCI-e 1TB SSD列為標配。
領先全國採用M2.2280界面之PCI-e規格硬碟1TB(PLEXTOR M9PeGN 1TB)，升級本系第一電腦教室，為當時最快速之SSD硬碟，以改善教學環境。
完成第二電腦教室建置及二間電腦教室子網路規畫,並且建置NAS伺服器,提供教師於研究室上傳授課資料,在上課時經由網路硬碟開啟。
- 2013
產學攜手專班畢業.日間部與進修部共八個班
- 2011
黃志文教授接任系主任
- 2009
成立教育部產學攜手合作專班
- 2008
黃國光教授接任系主任
- 2007
八個班的完整規模建立,達成日間部與進修部共八個班的完整規模
系館搬遷至現址:教學大樓六樓 - 2005
本校奉准改名為國立澎湖科技大學
- 2004
奉准每年招收進修部四技學生一班
- 2001
二專部逐年減班至九十一學年度起停止招生
奉准採以班換班方式，改為每年招收四技學生一班 - 2000
本校奉准改制為國立澎湖技術學院，本系更名為資訊管理學系
- 1998
科館搬遷至新建的實驗大樓三樓，開始招收二專雙班
- 1995
奉准獨立設校為國立澎湖海事管理專科學校
- 1994
成立資訊管理科，招收二年制專科生，科館位於現行政大樓前棟
- 1991
國立高雄海專澎湖分部奉准成立